壳聚糖不仅能抑制多种植物病原微生物的生长，还可以诱导植物产生广谱抗性、增强植物的自身防御能力，促进农作物产量提高，改善品质，有望作为一种新型的绿色农药，在农业生产中发挥重要的作用。

研究发现，壳聚糖对小麦赤霉病、棉花黄萎病、大豆花叶病等多种植物病害具有明显的防治效果。此外，壳聚糖对其他水果、蔬菜及花卉等病害也具有明显的防效和促生长作用，同时可提高产量13%～30%，如壳聚糖可显著提高苹果、梨的抗寒性及坐果率（与对照比可提高10倍），保叶率达80%左右。壳聚糖与杀菌剂混用，可以大幅降低杀菌剂用量（最高降低化学农药用量的90%），防治作物病害及提高产量效果明显。壳聚糖因其独特的作用机理已经成为一类全新的绿色生态农药。

壳聚糖主要通过两个途径有效防治作物病害：一是抑制植物病原菌生长，减弱病原物的侵染能力；二是与植物细胞上的受体结合，激发抗性信号分子产生，经过信号转导，激发抗性基因表达，产生抗性物质，从而达到防治病害的目的。

病原菌感染是引起农作物病虫害、造成作物减产的重要原因。壳聚糖作为植物营养物及植物生长调节剂，可以促进植物的生长和发育，同时还能够对某些真菌、细菌、病毒及害虫产生毒性，诱导植物启动防御系统，刺激有益微生物的生长和活性。另外，壳聚糖还可以形成屏障膜，螯合矿物质及营养物，将其同病原体隔离，并且阻止病原体中真菌霉素的释放。因此，壳聚糖在促进植物生长、农作物防病虫害和抗病等方面具有重要作用。

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