抑菌土是一类具备抑菌能力的土壤。在这类土壤中，或与土壤接触的微生物繁殖体受到抑制不能生长的现象。某些真菌孢子可以在土壤中保持长期的休眠状态而存活。这种效果对细菌、真菌都有显著的效果。同样的，在抑菌土中实施生防菌剂防治工作，也是受到限制的，往往会造成生防效果不稳定，或者表现差。

抑菌土根据抑菌作用分为很多种，如土传性真菌、细菌、线虫等。其中以土传性真菌病害最多。比如镰刀菌、小麦全蚀病、菠萝根腐病、丝核菌，细菌性根癌、孢囊线虫病、根结线虫病害等。

抑菌土的形成跟栽培环境和方式有直接关系。比如通过连作3~4年可以使小麦全蚀病的发病几率提高到60%,表现为小麦白穗。发展到5~6年达到严重病害，此后病害逐渐下降。再进行人工栽种却很难发病。

抑菌土的作用机制一是土壤微生物和土传病害的病原微生物的竞争作用，通过定植在浸染点或者病原物上进行营养竞争抑制；另一方面则是通过产生专性抗生素及其他抑菌物质。

保持土壤抑菌性，要根据实际情况对水、肥进行管理，促进微生物菌群数量的生长和保持，以改善土壤微生态环境。当然，若想要消除抑菌土的性能，通过高温热力处理，或者使用杀菌剂。但这样操作对作物并无好处。

利用抑菌土进行生物防治应用最好的就是小麦全蚀病，通过诱发小麦全蚀发病，在病害发生2~3年后，并出现衰退时，再进行两作，以维持土壤抗菌的防病作用，据统计可以使大田小麦增产30%。

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